Форум » О проблемах племенной деятельности » Некоторые статьи из инета по генетике. Просто для информации. И не только про собак. » Ответить
Некоторые статьи из инета по генетике. Просто для информации. И не только про собак.
Клара: ПОЛНОСТЬЮ РАСШИФРОВАН ГЕНОМ СОБАКИ Консорциум генетиков завершил расшифровку генетического кода собаки — породистого боксера. В процессе работы была также составлена карта однонуклеотидных полиморфизмов (SNP) собачьего генома. Как сообщает New Scientist, общий размер генома собаки составляет 2,4 млрд нуклеотидов (у человека 3,1 млрд), которые собраны в 39 пар хромосом (у человека 23). На самом деле первая расшифровка генома собаки — пуделя Шэдоу (Shadow) — была выполнена два года назад под руководством генетика-предпринимателя Крейга Вентера (Craig Venter). Однако тогда надежность прочтения была относительно низкой, да и расшифровано было только около 80% всего генома. Новая расшифровка выполнена консорциумом под руководством Керстин Линдблад-Тох (Kerstin Lindblad-Toh), содиректора Программы секверирования и анализа генома в Институте Броада (Broad Institute) при Массачусетском технологическом институте (MIT). На этот раз точность и полнота расшифровки генома собаки оказались значительно выше. В процессе расшифровки молекулы ДНК разбиваются на множество небольших фрагментов, каждый из них многократно копируется и считывается в ходе специального циклического химического процесса, в котором за один раз от фрагмента отделяется по одному нуклеотиду. Эта процедура, называемая секвенированием (от англ. sequence — последовательность), повторяется несколько раз, причем с разной разбивкой ДНК на фрагменты. На заключительном этапе компьютер “сшивает” фрагменты благодаря тому, что они перекрываются друг с другом. Точность этой “сшивки” тем выше, чем больше раз выполнялась процедура нарезки и считывания фрагментов. Кроме того, повторные прочтения позволяют избавиться от неизбежных случайных ошибок расшифровки. При секвенировании генома Шэдоу коэффициент избыточности составлял всего 1,5. Этого едва достаточно для того, чтобы осуществить сшивку фрагментов. В новом проекте охвачено 99% генома и при этом достигнута избыточность 7,5, что делает результаты намного более полными и надежными. Образцы ДНК для расшифровки были взяты у породистой собаки, боксера-суки по кличке Таша (Tasha). Ее предки многократно подвергались инбридингу, то есть близкородственному скрещиванию для закрепления породы. Инбридинг ведет к сближению двух комплектов генов, которые имеются в клетках организма, что значительно упрощает задачу расшифровки. Наряду с полной расшифровкой генома боксера были частично прочтены генетические коды еще нескольких пород собак, а также родственных видов — волка и койота. Как выяснилось, у разных пород геномы совпадают на 99,85%. Крохотный остаток 0,15% обеспечивает всё разнообразие пород собак — от громадных догов, до малышек чихуа-хуа. [more]выделено мной[/more]Сравнение геномов разных пород позволило также подготовить карту однонуклеотидных полиморфизмов (SNP), то есть таких мест, где разные версии генома различаются только одним нуклеотидом. Всего их обнаружено уже 2,5 млн, что сопоставимо с числом SNP у человека. Многообразие пород собак делает их удобной моделью для изучения различных вопросов медицины, эмбриологии и эволюционной биологии. Генетическое сходство с человеком (а геном собаки ближе к человеческому, чем, например, геном мыши) позволит значительно продвинуться в изучении таких генетически обусловленных заболеваний, как рак, эпилепсия и диабет, поскольку многие болезни у собак очень близки к заболеваниям людей. Из других интересных фактов исследователи отмечают, что некодирующие участки ДНК (то есть те, которые не входят в состав генов, задающих строение белков) в значительной мере совпадают у собаки и у человека. Высокая устойчивость этих участков говорит о том, что это важные элементы ДНК, стабилизированные естественным отбором, а вовсе не “генетический мусор”, как считалось еще недавно.
Ответов - 9
Клара: СКЛАДКИ КОЖИ У ШАРПЕЕВ ОБУСЛОВЛЕНЫ ГЕНЕТИКОЙ Ученые из Вашингтонского университета в Сиэтле (США) проанализировали гены 10 пород собак и нашли ответ на вопрос, почему шарпеи покрыты складками и морщинами. Фото Yann Arthus-Bertrand / Corbis. В ходе исследования специалистам удалось идентифицировать 155 различных участков в генетическом коде представителей разных пород, от которых может зависеть, получит ли пес какие-либо характерные черты внешности. Генетики также изучили ДНК 32 морщинистых и 18 гладких шарпеев и обнаружили, что у этих собак имеются четыре небольших, но очень важных отличия последовательности ДНК размером в один нуклеотид. Эти однонуклеотидные полиморфизмы располагаются на гене HAS2, отвечающем за выработку фермента синтетазы 2 гиалуроновой кислоты, который играет роль в создании кожного покрова. Возможно, какая-то мутация в данном гене обусловливает обилие складок у шарпеев. По словам ученых, в редких случаях мутантный ген присутствует и у людей; такие носители, как и собаки, обладают чрезвычайно морщинистой кожей. Напомним также: за то, будет ли собака кудрявой, лохматой или короткошерстной, отвечают три гена — RSPO2, FGF5 и KRT71. Разнообразные комбинации их вариантов определяют около 90% семи типов собачьей шерсти. От гена RSPO2 зависит, вырастут ли у собаки «усы» и «брови»; FGF5 отвечает за длину шерсти; KRT71 — за курчавость. По материалам Би-би-си.
Клара: УТОЧНЕНО ПРОИСХОЖДЕНИЕ СОБАК Группа ученых из Китая, Швеции, Ирана, Австрии, Германии и США выяснила, когда и на какой территории сформировался самостоятельный подвид волка — домашняя собака. Результаты проведенных ранее исследований свидетельствовали о том, что выделение собак в обособленный подвид произошло где-то в Восточной Азии; указать географическую область их происхождения с большей точностью было невозможно. «Гипотеза, представленная нами в 2002 году [см. статью в журнале Science], не получила однозначного одобрения научным сообществом, — рассказывает один из авторов работы Петер Саволайнен (Peter Savolainen) из Королевского технологического института (Швеция). — Надеюсь, новые данные изменят положение дел; мы внесли значительные уточнения в изначальную концепцию». Исследователи провели анализ полного митохондриального генома (16 195 пар оснований) 169 собак и 8 волков, а также изучили контрольный участок (582 пары оснований) генома 1 543 собак и 40 волков; в результате были выделены десять основных гаплогрупп собак. При этом наибольшее генетическое разнообразие (все десять гаплогрупп) было отмечено на территории Китая, к югу от реки Янцзы. Количество гаплогрупп в центральном Китае сократилось до семи, а в Европе их осталось всего четыре; такое распределение свидетельствует о том, что «родиной» собак следует считать юг Китая. В ходе дальнейшего анализа было определено время возникновения подвида (от 5 400 до 16 300 лет назад); ученым также удалось установить, что непосредственными предками собак можно считать несколько сотен прирученных волков. «Очевидно, взаимодействие с волками было очень важно для древних людей», — комментирует г-н Саволайнен. Необходимо отметить, что обозначенный период возникновения собак примерно совпадает по времени с переходом населения данной территории к занятию земледелием. Полная версия отчета исследователей будет опубликована в журнале Molecular Biology and Evolution.
Клара: ЛЫСЫХ СОБАК ЛИШИЛИ ШЕРСТИ СЕМЬ НУКЛЕОТИДОВ Виктор. Мексиканская голая собака (Xoloitzcuintli) Группа генетиков из разных стран определила причину отсутствия шерсти у лысых собак, сообщает портал Science News. Ученые выяснили, что в необычном внешнем виде таких животных "виноваты" всего семь нуклеотидов - элементарных "кирпичиков" ДНК. Исследователи описали детали своей работы в журнале Science. Лишенные шерстяного покрова породы собак были известны еще во времена ацтеков. Сейчас лысые щенки из пород китайских хохлатых собак, мексиканских голых собак и перуанских орхидей инков стоят больше 1000 долларов (при этом не все щенки из помета не имеют шерсти). Кроме отсутствия шерсти у лысых собак наблюдаются и другие отклонения: например, отсутствие или измененная форма зубов. Весь этот комплекс симптомов получил название эктодермальной дисплазии. За развитие заболевания могут отвечать несколько генов, но какой именно ген вызывает дисплазию у собак было неясно. Исследователи сравнили ДНК лысых и покрытых шерстью животных породы китайских хохлатых собак. Они выяснили, что отличия между ними находятся в одном из районов хромосомы 17. Ученые проверили также лысых и покрытых шерстью собак других пород и выяснили, что у всех животных причина дисплазии находится в одном локусе той же хромосомы. Генетики определили последовательность ДНК "виновного" района и выяснили, что у лысых собак наблюдается удвоение участка длиной семь нуклеотидов в гене FOXI3. У собак точные функции этого гена неизвестны, но у мышей он отвечает за формирование шерсти, усов и зубов. По мнению исследователей, из работа может помочь в разработке новых средств против облысения у людей. Терапию для собак генетики разрабатывать не собираются: эктодермальная дисплазия не осложняет животным жизнь и к тому же позволяет хорошо зарабатывать их хозяевам.
Клара: ГЕНЕТИКИ РАСКРЫЛИ ЗАГАДКУ БЕЛЫХ ЛОШАДЕЙ Международная группа генетиков во главе с исследователями из Университета Уппсалы обнаружила, что в основе изменения окраса лошадей в сторону серо-седых оттенков по мере их взросления лежит генетическая мутация. Результаты работы опубликованы в журнале Nature Genetics. Ученые установили, что все серые (седые) лошади являются носителями удвоенной копии определенного участка ДНК. Эта мутация стимулирует усиленное созревание меланоцитов – специализированных клеток кожи, ответственных за выработку пигмента меланина, который определяет цвет кожи и шерсти у животных, а также кожи и волос у человека. У серых (седых) лошадей активизируется, в первую очередь, рост меланоцитов, отвечающих за пигментацию кожи. Каждый меланоцит развивается из стволовой клетки, запас которых в организме ограничен. При этом из одних и тех же стволовых клеток могут развиваться либо меланоциты, которые отвечают за пигментацию либо кожи, либо шерсти. Таким образом, у седых лошадей запас стволовых клеток истощается на интенсивный окрас кожи, в то время как окрас шерсти постепенно сходит на нет. Лошадь сначала сереет, а затем может и полностью побелеть. Все белые лошади делятся на два основных типа – белорожденных, имеющих белоснежную шерсть и розовую кожу сразу при рождении. Такие лошади чрезвычайно редки. Второй тип – серые или седые. Жеребята этой масти рождаются с любым окрасом (вороные, гнедые или бурые), но с примесью белых волос. Эта примесь с каждой линькой увеличивается все больше и больше, и уже к возрасту от шести до восьми лет лошадь может стать полностью белой, хотя кожа будет оставаться пигментированной. Теперь ученым стал более понятен генетический механизм, лежащий в основе этого явления. По мнению ученых, когда люди только начали приручать лошадей, их привлекали животные белого цвета, поэтому они целенаправленно выводили таких лошадей. Довольно редкая мутация распространилась и встречается теперь гораздо чаще, нежели раньше в дикой природе. Помимо фундаментального научного значения, открытие генетиков, возможно, сможет помочь ветеринарам, так как известно, что более 75 процентов серых лошадей старше 15 лет болеют меланомой разной степени тяжести. Теперь врачи смогут лучше понять механизмы, ведущие к образованию опухолей.
Клара: Кстати, всё жизнь думала, что белых лошадей не существует. Вернее раньше писалось и считалось, что как таковой "белой масти" у лошадей не существует. Она назвается - серая. Потому, что хотя шерстинки и белого цвета, но кожа при этом у лошади остается - черной, или тёмно-серой. Но вот судя по статье - всё-таки они есть. Белая шерсть и розовая кожа... Век живи - век учись
Чже Чау: Да, по поводу белых лошадей, все время читала и слышала только, что все белые лошади рождаются серыми. Даже липпицианцы. Просто удивительную, Вы, Клара, работу шведов нашли!!!
Нона: Клара пишет: ГЕНЕТИКИ РАСКРЫЛИ ЗАГАДКУ БЕЛЫХ ЛОШАДЕЙ
Чже Чау: При всей любви ко всем-всем животным - краше лошади нет никого!!!!!!!!!!!!
Света 32: Чже Чау Это точно! Просто дух захватил от таких фотографий... Клара спасибо за статьи!
полная версия страницы